在大阪右下方乘船,途中遇到暴风雨,主角被冲到久须留岛,在岛上接受村长请求,在礼拜堂击败不知火幻庵。回到村长处,他告诉主角要想找到天草四郎时贞,必须有“天草の键”,而“天草の键”就隐藏在村中的某处,要通过鬼角岩找到它。按以下顺序与鬼角岩对话:东、西、北、南右、南左,然后便可在中间树下得到“天草の键”。乘船来到别府杀死七界道士,这三兄弟终于全被消灭。出村进入西南的阿苏山中,从山顶进入山口,经过漫长的山路见到另一礼拜堂。利用“天草の键”打开大门。在楼上时姬被マリア像恢复本性。

在山顶,天空中出现了一座天空城,时姬将主角送入天空城中。在第一、二层救出其它武士。在天空城顶部武士们封住了魔石,主角只身挑战天草回郎时贞……

危机过去了,是否还有新的危机出现呢?请看下回分解……

妖花恸哭之章

——霸王丸之卷

故事是由出云开始的。霸王丸从神社门前的神官处得知神社的入口被结界封印着,无法进入。来到宿屋左上方的草屋中找到花讽院和仲,他说魔界将侵犯人间,希望霸王丸前去阻止。此时最好在黑田屋找寻一位同伴。回到和仲处,得到“破邪の札”,这样便可以进入神社了。来到神社里,帮助柳生十兵卫消灭魔物后,四周忽然剧烈震动起来。众人冲出神社,发现许多房屋都在冒火,一艘巨大的要塞从天而降。柳生马上意识到这便是罗将神的第一步行动,他毫不犹豫地冲入要塞中。

在魔神要塞深处,一个名叫阿号的魔物正等在那里,身后有七个邪铜铎。这七个邪铜铎是吸收高手力量为罗将神所用的神器。柳生上前攻击,可是不管什么样的攻击都对阿号完全无效,终被击倒在地。这时和仲赶到,但为时过晚。柳生的魂魄已被邪铜铎吸取。和仲见情势急迫,只得使出超绝退魔封印奥义——岩缚,和阿号一起石化了。此时七个邪铜铎分别向世界各地飞去,霸王丸决定哪怕走遍天涯海角也要将这些邪铜铎毁去。

由要塞向上便到达出云门,经过一条简单的魔街道来到阿苏门,在地面上有一转移点可回到出云门,但无甚用处。到达阿苏山顶,正好听到一名罗将神的手下与一些魔物密谋令这座火山爆发,将九州的居民吞噬。
霸王丸发现有一个神秘的人物也在偷听,但他立即象风一样消失了。由左上进入洞口,沿着崎岖的山路走出阿苏山,然后一直靠东南方走,到达别府。

在别庥的锻冶屋上方屋中得知林中的温泉由于魔物的侵扰已经停止使用了。正在这时,众人感到了一阵剧烈的震动。在汤泽园门外,神秘人物再次出现并冲进了汤泽园。在园内消灭魔物得到了“岩滑りの石龄”。
在村子左上方有座猿山,使用“岩滑りの石龄”打开石门进入洞中。在深处见到魔物“破怨”及它身后的邪铜铎。神秘人加入战团,一场恶斗后,打败了破怨。神秘人使用法铃将邪铜铎震碎。神秘人说他是为了对付罗将神而来的疾风之铃音,并接受霸王丸的邀请加入了队伍。阿苏门中上方的通道终于可以走了,通过漩涡来到迷宫的最下方。在黑子右上方的石台上打倒一个魔物后得到“シヤンバラの盾”,由北京门出来到达北京。

在城右上方的一位老人说“死禁城”已经被一个钟散发出的邪气笼罩,请求霸王丸一行去消除邪气,说完他便消失了。在城左上角的王宅得知王虎王龙兄弟已进入死禁城,但一直没有出来。霸王丸决定探个究竟,于是便从天安门左方入口进入死禁城。先后击败三狼,解救出被囚百姓。再回到王宅接受王虎徒弟的请求去死禁城寻找王虎。北京菜馆的厨师交给霸王丸一盘“酢豚”,将其送给守卫便可进入死禁城。城中有许多看不到的墙壁,从右下绕到上方,行不久便被妖贵妃偷袭,将其打退后,王龙王虎终于出现,他们这时已被魔力操纵。一场战斗后,王虎苏醒而王龙离去。往上行,再一次遇到妖贵妃而霸王丸也看到死禁城内确有一个邪铜铎。经过努力消灭妖贵妃,邪铜铎也被铃音毁去了。